| | 保卫处 | 综治办 | 政保科 | 消防科 | 治安科 | 校卫队 | 户籍室 | 监控室 | |
 保卫处职责： |
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| 新疆医科大学保卫处和武装部两块牌子、一套班子，在一起合署办公，武装部政委由校党委副书记兼任，部长由保卫处处长兼任，保卫处主要负责做好学校的安全稳定、综合治理、消防安全、政保、集体户口管理工作，同时在业务上对各附属医院保卫科进行检查指导。保卫处现有正式职工 82 人（其中机关干部 15 人），聘用人员 37 人，共 119 人。下设五科二室，即综治办、政保科、消防科、治安科、校卫队、户籍室、监控室。 |
| 综合治理办公室职责： |
| 综合治理办公室是校党委领导下的综合治理委员会的办事机构，主要负责校内社会治安综合治理方面的工作。包括年度计划、总结和各专项活动的安排、检查、小结，以及同全校各下属单位签定责任书，监督、检查、落实各项综治工作，并对各单位进行考核、验收、评比、表彰。 |
| 政保科职责： |
政保科 是在保卫处领导下，为维护国家安全和校园政治稳定而进行具体工作的办事机构，其职责包括打击预防“三股势力”、“法轮功”对校园的渗透，做好敌情、社情、政情的情报收集，做好学校出国、赴特区出差等人员的政审，配合国家安全部门、公安机关做好发生在校内的政治案件侦破工作和重点人口的监管工作。 |
| 消防科职责： |
消防科 是在学校防火委员会和保卫处领导下办事机构，主要负责消防安全方面的工作。包括消防器材、设备的购置、配备、维修、保养，制定全校消防安全工作计划、建立健全防火制度、逐级签订防火安全责任书，做好学校的消防检查、督促、整改、落实工作，完成消防宣传、培训、演习和对易燃易爆、剧毒物品的存放监管工作。 |
| 治安科职责： |
治安科 在保卫处的领导下，主要负责全校的治安防范、治安调研、治安隐患排查等方面的工作，同时积极协助公安机关查处、侦破校内发生的各类刑事、治安案件。 |
| 校卫队职责： |
校卫队 在保卫处领导下主要负责全校各楼的安全值勤、校内巡逻、大门警戒、出入车辆管理、行政楼的值班保卫工作，同时在遇有紧急情况时，承担应急分队工作职责。 |
| 户籍室职责： |
户籍室 在处领导的领导下， 主要负责 做好学校集体户的迁出、迁入工作及各相关业务单位的协调、组织工作。 |
| 监控室职责： |
监控室 在处领导的领导下，主要负责对全校范围内实施监控，对各类政治、刑事、治安案件一经发现，立即上报处领导并将案件内容打包、摄像，对犯罪嫌疑人进行抓拍照片并做好相关记录，同时对监控设备进行日常维护、保养。 |
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